在万方论文查重率检测中，误判通常是由于系统算法的局限性或者文献相似度过高所导致的。系统可能会将原创内容与他人作品相混淆，也可能忽略了特定引用格式带来的误差。申诉时，作者可以提供原始数据、详细解释研究方法和结果，甚至寻求专业人士帮助，以证明论文的原创性。

申诉万方论文查重率误判的方式有多种，包括撰写申诉信函、提供原始数据和实验记录、寻求学术专家辅助等。作者在申诉时应当注意提供详尽的解释和证据，避免简单地否认查重结果。此外，与编辑或相关部门保持沟通也是解决误判问题的关键，通过积极合作和清晰沟通，有助于提高申诉的成功率。